โรงเรียนบงเหนือวิทยาคมเป็นโรงเรียนแบบสหศึกษาขนาดเล็กเป็นโรงเรียนประจำตำบลบงเหนือ ตั้งอยู่เลขที่ 162 หมู่ที่ 2 ตำบลบงเหนือ อำเภอสว่างแดนดิน จังหวัดสกลนคร 47110 ในพื้นที่ 60 ไร่ 3 งาน เปิดทำการสอนเมื่อเมื่อปีการศึกษา 2528 โดยมีฐานะเป็นโรงเรียนสาขาของโรงเรียนสว่างศึกษาเปิดทำการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 มีนักเรียนทั้งสิ้น 41 คน โดยใช้ศาลาวัดบริบูรณ์วรารามบ้านบงเหนือ อำเภอสว่างแดนดิน จังหวัดสกลนคร ในการจัดการเรียนการสอนปีการศึกษา 2529 เปิดสอนในระดับมัธยมศึกษาปีที่ 2 มีนักเรียน จำนวน 64 คน และได้ย้ายสถานที่เรียนใหม่ไปที่ อาคารเอนกประสงค์โรงเรียนชุมชนบงเหนือ ปีการศึกษา 2530 ได้เปิดทำการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 มีนักเรียนทั้งสิ้น 95 คน และย้ายที่ทำการสอนใหม่ไปที่ศาลาวัดไชยมงคล บ้านดอนหัน ตำบลบงเหนือ อำเภอสว่างแดนดิน จังหวัดสกลนครและในปีเดียวกันได้รับอนุมัติให้จัดตั้งโรงเรียนเป็นทางการ เมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม 2530 โดยตั้งชื่อว่า “โรงเรียนบงเหนือวิทยาคม” ซึ่งได้รับบริจาคที่ดินเพื่อสร้างอาคารเรียนอาคารประกอบจากประชาชนในชุมชน สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·อาคารเรียนชั่วคราว แบบ 104/27 ชั้นเดียว ใช้เป็นโรงฝึกงาน งบประมาณ 375,500 บาท
·บ้านพักครู 2 ชั้น 5 ห้องนอน งบประมาณ 375,500 บาท
·ห้องน้ำห้องสวม จำนวน 6 ที่ งบประมาณ 312,000 บาท
·บ้านพักภารโรง บ้านไม้ 2 ชั้น 1 ห้องนอน งบประมาณ 90,000 บาท
ปีการศึกษา 2531 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·อาคารเรียนแบบ 108 ล งบประมาณ 1,930,000 บาท
·บ้านพักครู แบบ 203/27 งบประมาณ 20,900 บาท
·ถังเก็บน้ำฝน ฝ.33 งบประมาณ 70,000 บาท
ปีการศึกษา 2532 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·บ้านพักครู แบบ 203/27 งบประมาณ 230,000 บาท
ปีการศึกษา 2533 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·ห้องน้ำห้องส้วม 6 ที่ งบประมาณ 156,000 บาท
·ถังเก็บน้ำฝน ฝ.33 งบประมาณ 90,000 บาท
ปีการศึกษา 2534 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·บ้านพักครู แบบ 203/27 งบประมาณ 356,000 บาท
ปีการศึกษา 2535 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·บ้านพักภารโรง บ้านไม้ 2 ชั้น งบประมาณ 121,000 บาท
ปีการศึกษา 2536 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·อาคารเรียน แบบ 108 ล งบประมาณ 3,869,000 บาท
·บ้านพักครู แบบ 205/26 2 ชั้น 5 ห้องนอน งบประมาณ 415,000 บาท
ปีการศึกษา 2537
·เปิดทำการสอนในระดับมัธยมศึกษาตอนปลายมีนักเรียนระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 4 จำนวน 34 คน
ปีการศึกษา 2538 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·อาคารเรียนแบบ 108 ล งบประมาณ 3,987,000 บาท
ปีการศึกษา 2539
·เปิดทำการสอนเต็มหลักสูตร ทั้งสองระดับ คือ มัธยมศึกษาตอนต้นและมัธยมศึกษาตอนปลาย
สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·หอประชุมแบบ 100/27 งบประมาณ 3,574,900 บาท
ปีการศึกษา 2541 สร้างอาคารเรียนอาคารประกอบ ดังนี้
·ประปาบาดาล งบประมาณ 369,000 บาท
ปีการศึกษา 2543
·มีการแต่งตั้งคณะกรรมการดำเนินการประกันคุณภาพการศึกษาภายในโรงเรียน ตาม พ.ร.บ. การศึกษาแห่งชาติ พุทธศักราช 2542 มาตรา 48 กำหนดให้มีการประเมินตนเอง
ปีการศึกษา 2551 ผ่านเกณฑ์การประเมินภายนอกจาก สมศ.รอบที่ 2
ปีการศึกษา 2557 ผ่านเกณฑ์การประเมินภายนอกจาก สมศ.รอบที่ 3
ปัจจุบัน เปิดทำการเรียนการสอน 2 ช่วงชั้น คือ ช่วงชั้นที่ 2 และช่วงชั้นที่ 3 โดยมีนายศุภชัย พิมพาเลีย ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการสถานศึกษา